معاونت تبلیغ
این معاونت با هدف ترویج فرهنگ خمس،برنامههای تبلیغی، میدانی و رسانهای را در سطح ملی و در مناسبتهای مختلف طراحی و اجرا مینماید. از جمله این فعالیتها میتوان به حضور مؤثر در نمایشگاههای بین المللی قرآن، برگزاری کارگاههای آگاهیبخش و تولید محتوای تبلیغی متناسب با گروههای هدف اشاره کرد.
معاونت آموزش
وظیفه اصلی این معاونت،طراحی و برگزاری دورههای آموزشی عمومی و تخصصی در حوزه خمس برای طلاب، فرهیختگان و کارشناسان است. این دورهها از سطوح مقدماتی تا پیشرفته، مبانی فقهی، اقتصادی و کاربردی خمس را با بهرهگیری از اساتید مجرب پوشش میدهد.
معاونت پژوهش
این معاونت متولی تولید دانش تخصصی و روزآمد در موضوع خمس است.فعالیتهای آن شامل اجرای طرحهای پژوهشی، انتشار مقالات علمی-پژوهشی، تألیف و ترجمه کتابهای تخصصی، و نیز برگزاری نشستهای علمی، میزگردهای تخصصی و همایشهای ملی میباشد.